猪舍消毒先将圈舍清扫干净，再用20%的石灰乳或3%的热烧碱水、20%的漂白粉进行消毒。消毒的次序为墙壁、圈栏、门窗、食槽、地面、用具及门口地面。消毒药水可用扫帚涂刷，也可用喷雾器喷洒。消毒完毕，圈舍门窗应关闭2～3个小时后再打开，同时将食槽及地面用清水冲洗干净。
土壤消毒泥土地面应先清除粪便、垫草等污物，然后再将上面的一层泥土铲除，最后用20%的漂白粉或20%的石灰乳、3%的热烧碱水浇洒。
粪便及污水消毒少量的粪便、垫草等可以深埋，如果粪便数量较多，可采用发酵法进行消毒。方法是在离猪舍稍远的地方挖一浅沟，沟深约40厘米、宽约2米，长度视粪便多少而定。先在浅沟底部铺一层健康猪的粪便，然后将病猪的粪便堆上，而后再盖一层健康猪的粪便及杂草，最后用稀泥密封。病猪粪便很稀时，可添加干土或干碎草，太干时可加入适量水。病猪舍的污水数量较少时可浇在粪便内一起发酵消毒，数量很多时可在污水中加入2%的生石灰粉或0.2%的漂白粉进行消毒。
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